新疆医科大学中医学院直属医院
新疆医科大学中医学院直属医院位于乌鲁木齐市鲤鱼山南路46号，始建于1992年，隶属于新疆医科大学管理的自收自支事业单位法人，经乌鲁木齐市卫生局批准设立的二级中医医院，编制床位99张。乌鲁木齐新市区银川路社区卫生服务中心设在该院，该院系国家中医特色社区卫生服务示范中心，是自治区和乌鲁木齐市城镇居民医疗保险定点医疗机构。
阿勒泰市人民医院
阿勒泰市人民医院是市政府所属的非营利性、公益性医疗机构，以医疗、预防、保健和科研教学为一体的综合性二级甲等医院，是新型农村合作医疗、市城镇居民和城镇职工医保定点医院，是农村孕产妇住院分娩补助、市民政局贫困救助“一站式”服务、地区艾滋病防治定点医院。是新疆医科大学第二附属医院和吉林省对口帮扶定点单位，帮扶专家每年十余名。
伊犁州新华医院
伊犁州新华医院是一所集医疗、教学、科研、预防、康复于一体的国家级三级综合医院，爱婴医院、北疆唯一一家“微笑列车”唇腭裂修复慈善项目定点医院，自治区包虫病外科手术定点医院，自治区人民医院“医疗集团联合体”合作单位，同时挂牌“伊犁州直艾滋病抗病毒定点医院”、“伊犁州职业病医院”、“伊犁州耐多药结核治疗定点医院”。先后获得自治区级文明单位、自治区行业作风建设先进集体、自治州民族团结进步模范单位、州直卫生系统先进集体、伊宁市综合治理先进单位等荣誉称号。现有职工964人，高级职称107人，中级职称176人；少数民族
新疆生产建设兵团第七师医院
第七师医院1994年12月建院，经过20多年的发展，目前已经成为是一所集医、教、研、康复、保健为一体的“三级甲等综合医院”。同时，是石河子大学医学院教学医院和国家爱婴医院。
新疆生产建设兵团第一师医院
新疆兵团第一师医院创建于1950年2月，坐落在天山主峰托木尔峰西南脚下、举世闻名的塔里木河上游北岸的新疆阿克苏市，是一所现代化的“三级甲等”综合医院、“国家爱婴医院”，是北京阜外心血管病医院、浙江大学医学院附属邵逸夫医院、山东青岛市立医院、湖北郧阳医学院附属太和医院、新疆医科大学第一附属医院医疗技术合作医院。2007年12月，挂牌成为新疆石河子大学医学院第四附属医院。2010年8月21日，挂牌成为中国医学科学院阜外心血管病医院心血管病技术培训中心。2014年10月由“二级甲等”医院变更为“三级”医院。20
新疆塔城地区人民医院
塔城地区人民医院始建于1936年，是一所集医疗、教学、科研于一体的三级甲等综合医院。担负塔城地区北四县（市）各族群众的医疗和保健工作，医院还承担地区传染病医院、地区紧急救援中心和地区精神卫生中心的管理服务职能。
昌吉回族自治州中医医院
昌吉州中医医院建于1988年，是一所以医疗、预防保健、科研、教学、康复及中医药文化传播为一体的三级甲等中医医院，是新疆医科大学实习医院，昌吉回族自治州工伤康复定点医院、城镇职工生育保险、商业保险医疗服务、基本医疗保险及城镇居民医疗保险定点医院，年门诊量20余万人次。
新疆维吾尔自治区人民医院
新疆维吾尔自治区人民医院始建于1934年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健和社区卫生服务为一体的大型综合性“三级甲等医院”。曾先后荣获“全国文明单位”、“全国百佳医院”、“全国五·一劳动奖状”、“全国卫生系统先进集体”、“全国万名医师支援农村卫生工程先进集体”、“全国十大百姓放心医院”、“全国卫生系统思想政治工作先进集体”、“自治区民族团结进步模范单位”等荣誉称号，是中国医院竞争力·顶级医院100强。
沙雅县人民医院
沙雅县人民医院位于沙雅县城正中，始建于1952年，是一所集医疗、教学、科研、预防及保健为一体的综合性二级甲等医院。医院定编床位280张，实际开放床位600张。医院现已拥有21个临床科室、3个医技科室，2个辅助科室，其中重点学科6个：骨胸外科、肝胆胃肠血管外科、脑科烧伤科、心血管高血压科、消化血液科和重症医学科及一个腔镜中心，该院2016年12月成立了2个中心，妇产中心及儿科中心。
新疆生产建设兵团第十三师红星医院
红星医院(石河子大学医学院哈密临床学院)1945年创建于革命圣地延安，其前身为白求恩国际和平医院第九分院，至今建院70年的历史。经过几代人的努力奋斗，已发展成为哈密地区集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的综合性三级甲等医院及全国爱婴医院。现为新疆医科大学、石河子大学医学院教学实习医院，是新疆医科大学第一附属医院、自治区人民医院、兵团医院、兰州军区乌鲁木齐总医院、自治区中医医院的协作医院。是卫生部北京医院、河南省人民医院、河南省中医院、河南省焦作市第一人民医院、河南省焦作市第二人民医院、河南省焦作市
新疆克拉玛依市独山子人民医院
中国大型石化基地－独山子人民克拉玛依独山子坐落在新疆天山北坡、准噶尔盆地南缘，属克拉玛依市的一个行政区，面积448平方公里，独山子是我国石油工业的发祥地之一，独山子石化公司具备1500万吨/年炼油、120万吨/年乙烯生产能力，建成投产的千万吨炼油百万吨乙烯工程，是目前国内最大的炼化一体化工程和西部大开发的标志性工程之一，也是新中国成立60周年“百项经典精品工程”之一。独山子紧邻欧亚大陆桥，乌奎、奎赛高速公路、奎北铁路在此交汇，与奎屯市、乌苏市构成新疆西部大开发战略天山北坡经济带的核心发展区域。独山子环境优
喀什市人民医院
喀什市人民医院是一家二级甲等综合医院。医院位于新疆维吾尔自治区喀什地区喀什市健康路5号。