乌鲁木齐米东区人民医院
米东区人民医院建院于1952年，医院占地面积17600平米，建筑面积46000平方米。目前是米东区规模最大，集医疗、预防、康复、保健为一体的二级甲等综合性医院，同时承担着米东区社区卫生服务中心公共卫生服务的一级服务体系。
乌鲁木齐国际医院
乌鲁木齐国际医院是市政府为建设“五大中心”对外开放平台，强化医疗服务中心合作功能，深化跨境远程医疗服务平台，跨境医疗旅游推介平台应用，打造具有国际服务水平的三级综合医院。国际医院位于乌鲁木齐市经济开发区莲湖路50号，距离乌鲁木齐高铁站约2公里，占地面积125亩，建筑总面积57000平方米。医院总床位数655张，学科建设齐全。医院于2019年8月16日正式开业。
霍尔果斯市人民医院
霍尔果斯市人民医院是一所集医疗、教学、急救、科研、预防保健和康复治疗为一体的，环境优美、功能齐全、设备先进、技术优良的综合医院，是新疆维吾尔自治区中医医院医疗技术协作医院、连云港市妇幼保健院友好合作医院、新疆医科大学附属肿瘤医院远程医疗协作单位、伊犁州新华医院医联体成员单位、国家精神心理疾病临床医学研究中心新疆分中心联盟单位、新疆眼耳鼻喉专科联盟单位、伊犁州领军专家郭永忠胃肠包虫病工作室、伊犁丝路职业学院（卫生健康学院分院）定点教学医院。
和田地区人民医院
和田地区人民医院始建于1938年，前身为新疆省立第七医院，1950年改称为和田专区人民医院。历经80余年的建设与发展，目前已成为和田地区唯一一所集医疗、教学、科研、预防、保健、急救为一体的现代化综合性医院。1997年被卫生部命名为“爱婴医院”，先后被评为“全国卫生文明建设先进集体”、“全国民族团结先进集体”、“自治区卫生系统行风先进集体”、“爱婴医院”。医院通过质量管理体系ISO9001认证，连续十年被评为“地区级精神文明单位”。2014年10月和田地区人民医院西院区正式设立。2015年2月我院被自治区卫
新疆医科大学第一附属医院
新疆医科大学第一附属医院始建于1956年，是国家第一个五年计划中156个重点建设项目之一。建院59年来，经过几代人的不懈努力，已逐步发展成为一所集医疗、教学、科研、预防和管理为一体的大型综合性研究型医院，是自治区最大的“三级甲等综合医院”之一。
乌鲁木齐市友谊医院
乌鲁木齐市友谊医院（乌市第三人民医院）创建于1948年，迄今已有59年历史，59年来医院始终坚持“病人至上，质量第一”、“一切以病人为中心”的办院宗旨，把提高医疗质量、服务水平、人才培养、学科建设、科研创新放在医院优先发展的重要地位，不断加强与国内各大医院的联系与合作，使医院的综合实力得到了全面的提升，现已发展成为乌鲁木齐市唯一一所集医疗、预防、教学、科研、保健、康复为一体拥有四家分院的国家级三级甲等医院、国家级爱婴医院、卫生部“国际紧急救援中心”，“亚洲紧急救援中心”定点医院及新疆医科大学临床医学院、自
新疆医科大学第一附属医院昌吉分院
新疆医科大学第一附属医院昌吉分院前身为昌吉市第二人民医院，是一所非营利性综合性二级甲等医院。2014年12月，新疆医科大学第一附属医院与昌吉市人民政府正式签署《托管合作框架协议》，按照理事会下的执行院长负责制，对昌吉市第二人民医院整体托管，进行为期30年的经营管理，共建新疆医科大学一附院昌吉分院。医院由科级升格为副县(处)级。
玛纳斯县人民医院
玛纳斯县人民医院始建于1954年,占地面积4.2万平方米，建筑面积2.8万平方米，经过60多年的奋斗与发展,现已成为集医疗、科研、教学、预防保健、康复和急救于一体的综合性二级甲等医院。也是城镇职工基本医疗保险、商业医疗保险、农牧区合作医疗、城镇居民医疗、劳动伤残鉴定、退休鉴定、大中专招生体检、征兵体检的定点医院,承担着全县7镇4乡2场1站及周边团场26万余人口的医疗救助工作。
新疆生产建设兵团第六师奇台医院
新疆生产建设兵团第六师奇台医院位于天山东段博格达峰北麓、准噶尔盆地东南缘的古丝绸之路边陲古城奇台县。医院始建于1959年4月，是新疆生产建设兵团驻昌吉回族自治州东三县（奇台县、木垒县、吉木萨尔县）唯一一所规模大、设备全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、急救、预防、保健于一体的二级甲等医院。医院开放床位450张，设有临床、医技、职能等科室38个，现有职工430余名，中高级专业技术人员百余名。医院服务范围泽及农六师东线垦区六个农牧团场（社区）及昌吉州东三县，区域服务人口50余万人。
阿勒泰地区哈萨克医医院
阿勒泰地区哈萨克医医院成立于1985年，是一所以哈萨克医为主的地区级二级甲等民族医医院。建院以来，医院注重继承、挖掘与整理，突出以“挖掘和弘扬哈萨克医药，突出特色，提升诊疗水平，不断推进哈萨克医药发展进程”的办院方向，在医院的服务功能不断得到完善和综合实力不断增强的同时，医院已发展成为哈萨克医药诊疗、研发基地和哈萨克医药人才的培养基地。
新疆阿克苏地区第二人民医院
阿克苏地区第二人民医院始建于1983年5月，地处阿克苏市东城区，北靠胡杨林公园,东临314国道。经过三十多年的发展，已成为一所集医疗、教学、科研、急救、预防和保健为一体的二级甲等综合医院。是地区、阿克苏市、农一师及社会各级各类医疗保险定点医院。医院占地面积10万平方米，医用建筑面积5.3万平方米，编制床位500张。设有职能科室15个，临床科室18个，医技科室6个，门诊、急诊、ICU、手术麻醉科独立设置。医院现有职工619人，其中卫生专业技术人员480人。有高级职称33人,中级职称79人,初级职称368人。
昌吉回族自治州人民医院
新疆昌吉州人民医院建于1955年。建院57年来，在州党委、州人民政府以及各级卫生主管部门的正确领导和关怀支持下，经过几代人艰苦奋斗、励精图治，各项事业发展迅速，现已成为昌吉地区规模最大的一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的三级甲等综合医院。医院不仅是新疆医科大学、石河子大学医学院及昌吉卫生学校的教学医院，还是自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、兰州军区乌鲁木齐总医院、福建医科大学各附属医院的技术协作医院，是昌吉州120紧急救援中心和昌吉州传染病院所在地。近年来，医院年门诊量46万人