哈密市维吾尔医医院
哈密地区维吾尔医医院是地区唯一一所一级甲等维吾尔医特色综合医院，现为新疆医科大学、自治区维吾尔医专、和田医专、喀什医专、哈密卫校等学校的实习医院。
和静县人民医院
巴州和静县人民医院，始建于1951年，是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复、理疗、社区服务和急救为一体的综合性二级甲等医院，曾先后获得自治区文明医院、自治区先进单位、自治区五佳医院等荣誉称号，并分别与自治区人民医院、新疆医科大第一附属医院、巴州人民医院建立协作医院。
哈密市中心医院
哈密地区中心医院是2000年由建院七十周年的地区人民医院与建院十五年的地区中医院合并组建，总建筑面积61288.18平方米，是一所具有中西医特色，集医疗、教学、科研及社区服务于一体的三级甲等综合性医院。先后被评为
新疆生产建设兵团第九师医院
九师医院始建于1969年，由工二师医院和农七师三管处医院合并组成。是一所集医疗、教学、科研、预防为一体的国家二级甲等医院、国家爱婴医院。
新疆生产建设兵团第六师医院
第六师医院创建于1953年，伴随着共和国半个多世纪的奋进历程，已经走过了六十七年的沧桑岁月，已发展成为集医疗、预防保健、康复等为一体的三级甲等综合性医院。
克孜勒苏柯尔克孜自治州人民医院
克孜勒苏柯尔克孜自治州人民医院成立于1954年7月，是自治州唯一一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的三级甲等医院。资产总额2.8亿元，业务用房总建筑面积62752平方米，编制床位898张。现有在岗职工1045人，其中高级职称95人、中级职称168人。
新疆生产建设兵团第十师北屯医院
新疆生产建设兵团第十师北屯医院(农十师北屯医院)始建于1959年，位于农十师师部所在地——北屯，是阿勒泰地区六县一市及十师八个农牧团场的交通枢纽，也是国道216线、省道318线、319线的交汇点、奎北铁路的终点站。
布尔津县人民医院
新疆布尔津县人民医院位于阿勒泰地区西三县中心位置，始建于1954年，迄今已有55年的建院历史，几十年来，在党和政府的关心、指导下，在各族人民群众的信赖、支持下，医院各项事业得到快速发展，现已发展成为专业设置齐全、技术力量优良、医疗设备先进、服务设施完善，集医疗、教学、急救、预防、保健为一体的综合性二级甲等医院。
伊犁州中医医院
伊犁哈萨克自治州中医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复为一体的三级甲等中医医院，医疗用地面积3000多平方米，年门诊量近100000人次，年收治住院患者4000人次，手术量3000多台。医院拥有专家学者200余名，其中高级专家学者14名，中级以上专业技术人员占40%，院内职工由10余个民族组成，是一个各民族团结和睦的大家庭。
新疆吉木萨尔县人民医院
新疆吉木萨尔县人民医院医院始建于1952年，是一所集医疗、教学、保健、康复、科研为一体的综合性二级甲等医院。总占地面积为2.66万平方米。现有职工总数410余人，其中专业技术人员360多人，副高级以上职称22人，中级职称85人，编制床位290张，实际开放床位400余张。经过近几年努力发展，已建成“园林式”的院落，为患者提供了“宾馆式”的医疗服务，成为目前县域内技术力量最雄厚、服务品质最优越的医疗机构。
塔城市人民医院
塔城市人民医院始建于1952年，是一所集医疗、教研、预防保健和社区卫生服务为一体的综合性二级甲等医院，是城乡居民医保和多家商业保险定点医疗机构，担负着塔城市各族群众的医疗保健任务。全院建筑面积34618.37㎡，设有临床、医技、职能科室共41个，年收治出院病人1万余人次，年门、急诊量达13万余人次。全院在职职工554人，核定床位360张，实际开放床位450张。拥有西门子Z3数字减影血管造影机、核磁共振（1.5T）、双排螺旋CT（64排128层）等高精医疗设备，为增强医院诊断能力，提高医院整体竞争水平，提供
兵团奎屯中医院
兵团奎屯中医院成立于2002年12月，目前全院拥有中医内科、外科、针灸推拿理疗科、肛肠科等临床科室，检验、B超，心电、放射、CT、中、西药房等医技科室，拥有妇科、皮肤、小针刀等特色门诊，现开放床位数100张，人员93人，其中专业技术人员76人（医生：28人，医技：10人，护理：30人，药剂：8人）；医院现有院领导四名，其中院长一名，副院长二名，工会主席一名；设有医务科、护理部、办公室、院感办、医保办等职能部门；2010年实现财务总收入：1143万元，出院病人数：1693人，门诊诊疗人次：10667人次。