新疆医科大学第六附属医院
崛起的新疆医科大学第六附属医院（新疆骨科医院），即原新疆建工医院始建于1957年，地处乌鲁木齐天山区五星路与红山路交汇处。历经几代人艰苦创业，开拓奋进，医院不断发展壮大，已成为集医疗、教学、科研、预防保健、社会（区）服务于一体、具有鲜明骨科特色的综合性二级甲等医院,现为新疆医科大学第六临床医学院。
阿瓦提县人民医院
阿瓦提县人民医院始建于1950年，发展至今，已成为一所全县唯一的一所集医疗、教学、科研、急救医学、预防保健为一体的综合性县级“二级甲等综合医院”，是自治区人民医院、绍兴市人民医院对口援建医院、是该县乡村卫生专业人员培训基地，承担全县120急救工作。设有30个临床、医技、职能科室。2013年门诊量达100427万余人次，住院病人13526人次，手术1743余例。
伊宁县人民医院
新疆伊宁县位于新疆伊犁哈萨克自治州，离首府伊宁市18公里，全县有45万人口，由维吾尔族、汉族、哈萨克族、回族等28个民族组成，是新疆北疆片区第一人口大县。成立于1952年的伊宁县人民医院是国家“二级甲等医院”、国家级“爱婴”医院、国家孕产妇质量监测医院、自治区包虫病手术治疗定点医院，是江苏省南通市卫生系统对口援疆单位，新疆医科大学第一附属医院、自治区人民医院远程会诊网络（协作）医院。近年来医院荣获了星耀中华最具成长力中国县市医院—管理之星奖，2017、2018连续两年跻身中国医院竞争力·排行榜县级医院30
新疆库尔勒市第二人民医院
库尔勒市第二人民医院（前身库尔勒铁路医院），成立于1984年12月，2004年12月由乌鲁木齐铁路局整建制交库尔勒市政府，性质为差额事业单位，位于库尔勒市新城南路28号，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的二级甲等综合性医院。
新疆维吾尔自治区中医医院
新疆维吾尔自治区中医医院暨新疆医科大学附属中医医院、新疆中医药研究院及新疆中医名医名方研究开发中心，目前是中国西北地区规模最大的综合性三级甲等中医医院。
喀什地区第一人民医院
座落于“西域明珠”——新疆喀什古城的新疆喀什地区第一人民医院成立于1934年，是一所集医疗、教学、科研、预防于一体的地州级综合性（二级甲等）医院，医院占地面积7万余平方米，医疗业务用房面积4万余平方米，开放床位500张，在职职工730人，其中卫生技术人员550人，高级职称专家40人，中级职称技术骨干136人。现设临床科室17个，医技科室9个，地区急救中心、眼科中心、血液净化中心、内窥镜中心等设在该院，还设有ICU、CCU重症监护室。改革开发以来，医院不断加强基础设施建设，更新医疗设备。
新疆医科大学第二附属医院
创建于1954年，经历了50多年风雨历程的新疆医科大学第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、康复、预防为一体的省级综合医院，国家卫生部首批认定的“三级甲等”医院，自治区政府评定的“患者满意单位”和自治区级文明单位。
且末县人民医院
是一家国有的二级甲等级医院，是当地医疗的主要承担者，负责当地人民的医疗保障，是各地医学专业学员的实习基地。
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乌鲁木齐经济技术开发区(头屯河区)第一人民医院
经济技术开发区（头屯河区）第一人民医院(原乌鲁木齐市头屯河区中心医院）是一所集预防、保健、医疗、教学、康复为一体的综合性二级甲等医院，编制床位数230张。隶属乌鲁木齐经济技术开发区（头屯河区）人民政府管理。
巴音郭楞蒙古自治州人民医院
巴音郭楞蒙古自治州人民医院（简称巴州人民医院）是自治州境内规模最大、医疗技术水平较高、各项正向指标在全疆地州级医院位置居前的一所综合医院。
新疆医科大学第五附属医院
新疆医科大学第五临床医学院暨第五附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的综合性三级甲等医院，位于乌鲁木齐市高新区（新市区）中心地带，占地面积约5万平方米，建筑面积约12万平方米，始建于1937年，是自治区首家命名的三级甲等综合医院。医院拥有20个自治区临床重点专科和1个全国综合医院中医药工作示范单位。2014年被健康报评选为“全国最具公信力三级甲等医院”。